Đã từ lâu, Jason Boue trở thành một kẻ không tổ quốc, không quá khứ và không ký ức. Từng là một cỗ máy giết người hiệu quả nhất trong lịch sử CIA, nhưng nhân vật đắt giá này đột nghiên quay đầu lại và bị cả một hệ thống an ninh tìm cách trừ khử.

Phần 3 bắt đầu bằng cảnh tiếp nối đoạn cuối của The Boue Supremacy, khi Jason Boue (Matt Damon) lẩn trốn cảnh sát Moscow. Bị dồn vào chân tường, chàng điệp viên mất trí nhớ lẩn vào một trung tâm y tế. Quật ngã một viên cảnh sát, anh khống chế một người khác và trốn khỏi hiện trường.

Sáu tuần sau, Boue tới Paris gặp em trai của Marie Kreutz, người bạn gái bị bắn chết tại Ấn Độ. Trên đường, anh đọc được bài báo trên tờ The Guardian của phóng viên Simon Ross (Paddy Considine), miêu tả Jason Boue là một đặc vụ CIA. Quyết tìm ra sự thật về bản thân, Boue tìm cách gặp Ross tại London, trong ga tàu điện Waterloo đông đúc nhất thủ đô Anh quốc.

Kiên trì kế hoạch loại bỏ kẻ phản bội nguy hiểm, CIA cho người giám sát Ross ngay sau khi phát hiện ra từ khóa “Blackbriar” khi chàng phóng viên nói chuyện qua điện thoại di động bằng mạng Echelon. Bọn họ tin rằng Ross tới nhà ga để gặp người cung cấp thông tin cho bài viết về Boue. Nhưng mọi thứ không qua được mắt của chàng điệp viên sừng sỏ. Lẩn vào đám đông, anh khôn khéo liên lạc với Ross.

Noah Vosen (David Strathai), kẻ đứng đầu chiến dịch Blackbriar, lệnh cho sát thủ bắn chết Ross và nguồn tin bí mật. Qua hệ thống camera an ninh của sân ga, đội của Vosen phát hiện ra kẻ cung cấp tin bí mật chính là Boue. Hoảng sợ trước tình huống nguy hiểm, Ross bất cẩn lọt vào tầm ngắm của sát thủ và bị bắn chết. Còn Vosen sững sờ khi nhìn thấy Boue ở ngay trước mắt.

Pamela Landy (Joan Allen), Phó giám đốc CIA được đề nghị giúp đỡ truy tìm Boue. Với sự giúp đỡ của cô, Vosen và đội của hắn xác minh được nguồn tin của Ross là Neal Daniels (Colin Stinton), trưởng chi nhánh CIA tại Madrid. Daniel trở thành cái đích tiếp theo trong kế hoạch thanh trừng của Vosen. Nhưng Daniel đã nhanh chân hơn, chuyển một tài khoản 100.000 dollar và trốn sang Tangier. Khi Boue lần theo manh mối đến văn phòng của Daniel, anh bất ngờ gặp lại Nicky Parsons (Julia Stiles). Đánh gục hai sát thủ của Vosen, Boue kéo theo Nicky bỏ trốn và theo dấu Daniel tới Tangier. Nhưng chàng điệp viên vô tình đẩy Daniel vào chỗ chết.

Phát hiện Nicky phản bội, Vosen điên tiết hạ lệnh thủ tiêu cả cô gái. Quyết định của hắn đụng phải sự phản ứng dữ dội của Landy. Nhưng quyền lực nằm cả trong tay Vosen, hắn cho người bí mật theo dõi Landy.

Từ Tangier, Boue trở về Mỹ. Phát hiện ra anh dùng hộ chiếu giả, Landy tìm cách liên lạc. Cô bí mật báo cho Boue địa chỉ cơ sở đào tạo điệp viên nằm tại New York, "ngôi nhà cũ" của anh, là nơi khởi đầu của những kế hoạch bẩn thỉu, cũng là nơi chàng đại uý David Webb biến thành điệp viên Jason Boue, kẻ phản bội nguy hiểm của CIA…

Lần thứ 3 Matt Damon vào vai Jason Boue, chàng điệp viên anh hùng của đạo diễn Paul Greengras. Chỉ riêng tháng 8, Tối hậu thư của Boue đã mang về khoản tiền bán vé 72 triệu USD. Những âm mưu đen tối, những chương trình đào tạo phi nhân tính mang danh vì lợi ích quốc gia, những cá nhân xuất sắc bị đẩy vào con đường không có lối thoát chỉ vì lòng yêu nước mù quáng… Tiết tấu nhanh, căng thẳng, đầy kích động và không có thời gian chết, phần 3 series phim về Boue tràn ngập cảm giác hồi hộp mong đợi giờ phút công lý được thực thi.

Jason Boue là một đối thủ cạnh tranh cân sức với siêu điệp viên James Bond hay người hùng Ethan Hunt của series Nhiệm vụ bất khả thi, tuy ở thế đối lập và kém vinh quang hơn nhiều so với hai đồng nghiệp nổi tiếng. Chạy trốn khắp thế giới, anh chỉ có khát khao tìm ra sự thật về bản thân mình, chứ không phải là những kế hoạch cứu thế giới hay truy bắt tội phạm quốc tế. Cảm giác đè nặng và ngộp thở luôn xuất hiện mỗi khi có kẻ lạ mặt nào đến gần Boue. Nhớ hết và không tha thứ, anh dần lấy lại trí nhớ và trả thù những kẻ đã đẩy mình vào đường cùng. Đạo diễn Paul Greengras đã thành công chỉ với những yếu tố: một cuộc săn đuổi đến tận cùng con đường sống, những giây phút căng thẳng tiếp nối không ngừng, những mưu toan cấp chính phủ…

Đoàn làm phim phải mất tới 6 tuần chỉ dành riêng cho việc thực hiện cảnh rượt đuổi bằng ô tô trên đường phố New York, một trong những trường đoạn gay cấn nhất của phim. Và cảnh sát đã phải cấm họ chạy xe trên 57km/h, vì sợ làm khách qua đường bị thương.

Các nhà sản xuất cũng phải đàm phán với chính phủ Tây Ban Nha về 5 tháng ghi hình tại xứ sở của những chú bò tót, tại những địa điểm như nhà ga Atocha tại thủ đô Madrid, nơi xảy ra vụ đánh bom khủng bố vào ngày 11/3/2004. Quá trình quay phim phải nằm dưới sự giám sát chặt chẽ của cảnh sát cũng như hệ thống hàng trăm camera an ninh.